Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn3Q64691 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms