Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms