Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms