Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp4aQ64436 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp4aQ64436 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms