Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt12Q64291 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt12Q64291 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms