Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pan3Q640Q5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms