Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms