Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms