Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxa13Q62424 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Hoxa13Q62424 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Hoxa13Q62424 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Hoxa13Q62424 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa13Q62424 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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