Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpaQ62189 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpaQ62189 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms