Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3cQ62181 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema3cQ62181 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms