Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Pabpc2Q62029 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pabpc2Q62029 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pabpc2Q62029 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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