Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctr9Q62018 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms