Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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E2f1Q61501 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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E2f1Q61501 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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E2f1Q61501 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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E2f1Q61501 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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E2f1Q61501 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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E2f1Q61501 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2f1Q61501 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms