Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms