Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms