Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scarb1Q61009 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Scarb1Q61009 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Scarb1Q61009 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Scarb1Q61009 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scarb1Q61009 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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