Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd6Q61003 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms