Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms