Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp7Q60973 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms