Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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