Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ppp1r1bQ60829 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms