Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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Cnot7Q60809 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Cnot7Q60809 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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Cnot7Q60809 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Cnot7Q60809 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot7Q60809 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms