Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Traf3Q60803 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms