Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf4Q60793 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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