Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf3Q60765 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atf3Q60765 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms