Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcf4Q60722 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms