Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SkiQ60698 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkiQ60698 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms