Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms