Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PtprnQ60673 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PtprnQ60673 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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PtprnQ60673 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PtprnQ60673 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PtprnQ60673 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PtprnQ60673 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PtprnQ60673 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PtprnQ60673 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprnQ60673 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PtprnQ60673 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms