Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm1Q60636 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms