Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CttnQ60598 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CttnQ60598 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms