Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdcp1Q5U462 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdcp1Q5U462 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms