Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NacadQ5SWP3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
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