Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42Q5SV66 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms