Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tns3Q5SSZ5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms