Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms