Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms