Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85aQ5SP85 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms