Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms