Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps41Q5KU39 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms