Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hs3st6Q5GFD5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hs3st6Q5GFD5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hs3st6Q5GFD5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hs3st6Q5GFD5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hs3st6Q5GFD5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hs3st6Q5GFD5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hs3st6Q5GFD5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hs3st6Q5GFD5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hs3st6Q5GFD5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hs3st6Q5GFD5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hs3st6Q5GFD5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hs3st6Q5GFD5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms