Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Gm3558Q5FWC9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3558Q5FWC9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3558Q5FWC9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3558Q5FWC9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3558Q5FWC9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3558Q5FWC9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3558Q5FWC9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3558Q5FWC9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3558Q5FWC9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3558Q5FWC9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3558Q5FWC9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3558Q5FWC9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3558Q5FWC9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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