Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms