Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms