Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc8bQ5DU41 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms