Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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