Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufaf2Q59J78 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms