Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrig2Q52KR2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms