Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms